Η Λένα Φλυτζάνη γεννήθηκε και μεγάλωσε στη Θεσσαλονίκη. Σπούδασε Νομική, ωστόσο στην πορεία των σπουδών της ο δρόμος της δημοσιογραφίας της κέντρισε περισσότερο το ενδιαφέρον.
Η ίδια λοιπόν, ξεκίνησε μαθήματα δημοσιογραφίας, παράλληλα με την άσκησή της σε δικηγορικό γραφείο της Αθήνας.
Έκανε τα πρώτα της βήματα στον τηλεοπτικό σταθμό του ΣΚΑΙ και μπήκε πολύ γρήγορα στα βαθιά. Η Λένα Φλυτζάνη ασχολήθηκε με το ελεύθερο ρεπορτάζ, την συμπαρουσίαση αλλά και τα δελτία ειδήσεων και πολύ πρόσφατα ραδιόφωνο. Αναγνωρίζει τις δυσκολίες, όμως δεν μετανιώνει για την απόφασή της.
Η Λένα Φλυτζάνη σε πρόσφατη συνέντευξή της στο ladylike.gr περιέγραψε τους λόγους για τους οποίους επέλεξε να ακολουθήσει την δημοσιογραφία, λέγοντας: «Η ταχύτητα, η αδρεναλίνη, η ανάγκη να ξέρεις ότι εσύ είσαι η πηγή για να περάσει η είδηση στον τηλεθεατή, με τρελαίνουν. Αν δεν τα αγαπάς όλα αυτά, δεν αντέχεις για πολύ.
Ο ανταγωνισμός υπάρχει αλλά αν τον αφήσεις να σε επηρεάσει – ειδικά στην αρχή σου που έχεις ανασφάλειες και αμφιβολίες κι όλοι περιμένουν να δουν αν θα τα καταφέρεις- είναι καταστροφικός. Πέρασα δυο χρόνια με πολλή δουλειά για την εκπομπή και παράλληλα διεθνείς ειδήσεις για το δελτίο»
Η Λένα Φλυτζάνη στο παρελθόν παρουσίαζε εκπομπή με τον Δημήτρη Υποφάντη ενώ αργότερα παρουσίαζε μαζί με τον Δημήτρη Καμπουράκη την εκπομπή «Σαββατοκύριακο Παρέα».
Σχετικά με το αν έχει δεχτεί κακές συμπεριφορές στον χώρο της τηλεόρασης, η δημοσιογράφος είχε αναφέρει στην ίδια συνέντευξη: «Σεξιστικά σχόλια ή υπονοούμενα μπορεί να ακούσεις, αλλά αυτή είναι η εύκολη λύση για αυτόν που το κάνει γιατί αδυνατεί να δει πιο βαθιά. Bullying γιατί είμαι νέα ή γιατί είμαι γυναίκα δεν έχω δεχθεί. Αμφισβήτηση και οι πιο μεγάλοι νιώθουν. Άλλο η κριτική, άλλο η αμφισβήτηση.
Η Λένα Φλυτζάνη έχει επιλέξει να κρατά την προσωπική της ζωή σε χαμηλούς τόνους, καθώς θέλει να απασχολεί μόνο με την δουλειά της.
Το καλοκαίρι του 2021 είχαν κυκλοφορήσει κάποια δημοσιεύματα που ήθελαν την παρουσιάστρια να βρίσκεται σε σχέση με τον ρεπόρτερ Αντώνη Κρητικό. Οι δυο τους γνωρίστηκαν στα πλατό του ΣΚΑΪ και της εκπομπής «Σαββατοκύριακο Παρέα». Πρόκειται για δύο ανθρώπους χαμηλών τόνων που δεν επιβεβαίωσαν ποτέ την είδηση.
